 |
Морской биобанк ...ресурсная коллекция, центр коллективного использования |
Шапочка список
ННЦМБ
Национальный научный центр морской биологии им. А.В. Жирмунского ДВО РАН
Liquid nitrogen vapor BIOSAFE 420
Fig_4a.jpg
Fig._17a.jpg
Fig._7a.jpg
Новости
9/02/2023
9 февраля 2023 г. состоялось видео-совещание в рамках Российско-Американского проекта P21AS00337 “Collaborative research to investigate and communicate the distribution, toxicity, connectivity, and human health risks of Harmful Algal Blooms in Beringia» 2022-2024, который предполагает проведение совместных исследований по проблеме Вредоносного цветения воды, информированию о распространении, токсичности, и рисках для экосистем и здоровья человека, обусловленных возрастающей интенсивностью цветений токсичных микроводорослей в зоне Берингии, объединяющей Чукотку и Аляску. Данное сотрудничество затрагивает важные вопросы обеспечения безопасности пищевых продуктов, представляющих общий интерес как для населения российской Чукотки, так и для жителей прибрежных районов американской Аляски.
С американской стороны в совещании приняли участие руководитель проекта Дон Андерсен - Dr. Donald M. Anderson Director of the U.S. National Office Harmful Algal Blooms, a Senior Scientist in the Biology Department of the Woods Hole Oceanographic Institution Visit the Anderson Lab website, Минди Ричлен - Mindy L. Richlen - Assistant Director of the U.S. National Office for Harmful Algal Blooms и Евангелина Фэчон - Evie Fachon -Joint Program student https://hab.whoi.edu .
С российской стороны в совещании приняли участие сотрудники ННЦМБ ДВО РАН : Орлова Т.Ю. (руководитель Центра мониторинга вредоносных микроводорослей и биотоксичности прибрежных морских акваторий Дальнего востока РФ – www.imb.dvo.ru/misc/toxicalgae/index.htm ) и Морозова Т.В. (руководитель ЦКП «Морской биобанк»– www.marbank.dvo.ru ).
В ходе встречи обсуждались результаты и перспективы мониторинга токсичных микроводорослей, в частности динофлагеллят Alexandrium catenella, известного как продуцент фикотоксинов STX – группы, вызывающих паралитическое отравление моллюсками (PSP –paralytic shellfish poisoning). Участники встречи отметили нарастающую интенсивность «красных приливов», вызванных Alexandrium catenella на акватории Берингова и Чукотского морей, обусловленную климатическими изменениями .Также участники встречи подчеркнули необходимость информирования местного населения о рисках для здоровья, связанных с токсичными цветениями воды в зоне Берингии, где экономика в значительной степени основана на натуральном хозяйстве.
Фотографии с экрана компьютера во время совещания, проходившего 9 февраля 2023 г. с 8:00 до 9:30 по Владивостокскому времени.
15/12/2022
14 декабря сотрудники ЦКП "Морской биобанк" прошли обучение на онлайн-семинаре, посвященном различным аспектам работы в программе «Арктикс».
«Арктикс» - это лабораторная информационная система (отечественный аналог программы FreezerPro), цель которой систематизация и управление хранением биоматериала.
08/12/2022
ЦКП «Морской биобанк» ННЦМБ ДВО РАН продолжает участие в разработке отечественных систем индикации фикотоксинов в морской воде, морских осадках и морепродуктах.
28-29 ноября 2022 г. сотрудники «Морского биобанка» приняли участие в презентации разработанных московскими учеными тест-систем для экспресс-определения токсинов микроводорослей. На презентации были представлены изделия отечественной разработки:
- тест-система для экспресс-определения окадаевой кислоты в моллюсках - «ТС-ОК»
- тест-система для экспресс-определения микроцистина в воде и рыбе – «ТС-МЦ».
На данном мероприятия участники не только познакомились с отечественными изделиями для экспресс-индикации фикотоксинов, но и увидели демонстрационные эксперименты по оценке их эффективности и аналитических характеристик.
Присутствующим на презентационном мероприятии учёным показали, что тест-система ТС-ОК, предназначенная для выявления окадаевой кислоты (ОК) методом иммунохроматографии в моллюсках (мидия, трубач, устрица, морской гребешок, вонголе, теллина), обеспечивает достоверное обнаружение ОК в тканях моллюсков различных видов во всех пробах, содержащих токсин в концентрациях от 40 нг/г и более (160 нг/г установленное предельно допустимое содержание ОК в тканях моллюсков).
При анализе контрольных образцов экстракта гомогената тканей моллюсков на наличие ОК с использованием тест-системы ТС-ОК, пороговая чувствительность составляла не более 1,3 нг/мл, а 100 %-ая ингибирующая концентрация ОК - не более 10 нг/мл. Отмечено, что при анализе контрольных образцов экстрактов гомогенатов тканей моллюсков, содержащих ОК и близкородственные токсины DTX-1 и DTX-2, экспериментальный образец тест-системы ТС-ОК выявлял токсины с эффективностью: ОК - 100 %; DTX-1, DTX-2 - от 50 % до 100 %.
Рис. 1. Проанализированные моллюски - мидия, трубач, устрица, морской гребешок, вонголе, теллина (слева направо)
Рис. 2. Образец тест системы ТС-МЦ и и результаты демонстрационного определения окадаевой кислоты в гомогенате мидии.
Тест-система ТС-МЦ, предназначенная для выявления микроцистина методом иммунохроматографии в питьевой воде, воде открытых водоёмов и рыбе, обеспечивала достоверное обнаружение микроцистина в питьевой воде в концентрации от 0,2 нг/мл, в речной воде в концентрации от 2,0 нг/мл, а в гомогенате ткани рыбы - в концентрации от 10,0 нг/мл.
При анализе контрольных образцов питьевой воды, содержащих разные виды МЦ и нодуларин, тест-система ТС-МЦ выявляла различные виды микроцистинов и нодуларина с эффективностью: МЦ-LR - 100 %; МЦ-HtyR, МЦ-YR, МЦ-LR[D-Asp3], МЦ-WR, МЦ-HilR, МЦ-RR и МЦ-RR[D-Asp3] - от 50 % до 100 %; нодуларин - от 30 % до 60 %.
Продемонстрированные тест-системы ТС-ОК и ТС-МЦ изготовлены в виде тест-полосок (стрипов), а процедура анализа занимает не более 30 минут и не требует высокотехнологичного оборудования. Оригинальным решение разработчиков является наличие на тест-полоске «линии сравнения», упрощающей визуальную регистрацию результатов тестирования.
Отрадным является факт появления на отечественном рынке доступных отечественных изделий для экспресс-определения ряда токсинов микроводорослей. Разработанные тест-системы могут не только послужить инструментом для контроля качества воды, пресноводной рыбы и морепродуктов, но и позволяют расширить арсенал средств для проведения научных изысканий.
21/11/2022
Сотрудники Морского биобанка ННЦМБ ДВО РАН продолжают мониторинг микроводорослей в Амурском заливе. Если летом этого года в заливе регистрировалось беспрецедентное по продолжительности и интенсивности "цветение" микроводорослей, обусловленное массовым развитием диатомовых, динофитовых, рафидофитовых и криптофитовых водорослей, то осеннее "цветение" фитопланктона вызвано только диатомовыми рода Pseudo-nitzshia. Вспышка численности клеток Pseudo-nitzshia pseudodrlicatissima/delicatissima complex (до 3.48 млн клеток/л) была отмечена в конце августа-начале сентября. А в начале ноября массовое развитие клеток Pseudo-nitzshia cf. fraudulenta (свыше 8 млн клеток/л) стало причиной максимально высокого за год значения биомассы фитопланктона в заливе (свыше 11 мг/м3 Chl a) (Рис.1). Сопутствующим видом в обоих случаях была Pseudo-nitzschia pungens. Наибольшая численность клеток отмечена в толще воды (т.е. в промежуточном горизонте) (Рис 2). Все упомянутые виды известны как продуценты домоевой кислоты, вызывающей амнезическое отравление моллюсками (ASP) при употребление их в пищу. Симптомами отравления являются диарея, рвота, головная боль, спутанность сознания, дезориентация, а в тяжелых случаях - амнезия и фатальная кома.
Рис. 1. Фотография клеток Pseudo-nitzshia cf. fraudulenta и график, демонстрирующий динамику численности клеток Pseudo-nitzschia ssp. на мониторинговой станции в Амурском заливе летом-осенью 2022 г.
Рис. 2. Результаты измерений температуры, солености и хлорофилла А на станции мониторинга (СМ) ННЦМБ с 3 июля по 18 ноября 2022 г.
столбик А) - сверху вниз - температура, солёность и хлорофилл А, усреднённые в слое от поверхности до дна (данные профилирования зондом ASTD102 на станции мониторинга ННЦМБ;
столбик Б) – профили параметров, измеренных на станции мониторинга ННЦМБ 01 ноября, а также 12 июля и 29 августа для хлорофилла А;
столбик В) – распределения параметров, измеренных 01 ноября 2022 г. на разрезе ННЦМБ – г. Приметная.
11.11.2022
Завершено исследование явления Вредоносного цветения водорослей (ВЦВ), произошедшего осенью 2020 года у берегов Камчатки и сопровождавшегося массовой гибелью гидробионтов и отравлениями людей. Исследования, проведенные с помощью световой и сканирующей электронной микроскопии, а также рамановской спектроскопии показали, что возбудителями ВЦВ, были динофлагелляты рода Karenia. Масштабы цветения, которое продолжалось более двух месяцев и охватывало обширную акваторию юго-восточного и юго-западного прибрежья п-ва Камчатка оценивали с помощью дистанционных методов. Молекулярная филогения показала, что доминировал вид K. selliformis, принадлежащий к холодноводной группе I и идентичен виду, вызвавшему ВЦВ в октябре 2021 г. у берегов Хоккайдо в Японии, также сопровождавшегрося катастрофической гибелью морских ежей и рыб. По результатам исследования опубликованы две статьи в высокорейтинговом журнале Harmful Algae https://doi.org/10.1016/j.hal.2022.102337 , https://doi.org/10.1016/j.hal.2022.102204
Готовится определитель вредоносных микроводорослей прибрежья Камчатки.
В рамках Гос.задания 1022022400001-0-1.6.16 "Комплексный мониторинг микроводорослей, вызывающих цветение воды и продуцирующих фикотоксины, у берегов Камчатки и на сопредельных акваториях" , подготовлена и зарегистрирована база данных "Продуценты фикотоксинов в прибрежных водах Камчатки: видовое разнообразие, распространение и токсигенность". В представленной базе обобщены результаты 40-летних исследований микроводорослей, вызывающих вредоносное цветение воды (ВЦВ) и продуцирующих фикотоксины в прибрежных водах Камчатки. Эти данные включают информацию о видовом разнообразии, сезонной динамике и обилии видов, продуцирующих фикотоксины и вызывающие ВЦВ. Дано картирование Камчатки с указанием мест возможного возникновения разных типов ВЦВ. Эта работа важна для понимания и прогнозирования экологической ситуации в прибрежных водах полуострова, оценки возможного негативного воздействия ВЦВ на прибрежные морские экосистемы, гидробионтов, млекопитающих и птиц, а также здоровье людей. Представленная база данных является основой для реализации государственной политики управления и мониторинга ВЦВ в водах Камчатки, являющимися важнейшей рыбохозяйственной акваторией РФ.
26.09.2022
22 сентября "Морской биобанк" принял участие в работе V Юбилейный Международный Форум онкологии и радиотерапии "ForLife" | "Ради жизни", который проходил с 19 по 23 сентября 2022 г. в гибридном формате: очно на площадке Центра международной торговли (ЦМТ), г. Москва, Краснопресненская наб., 12; в формате онлайн-трансляции в личном кабинете на сайте мероприятия: https://forum-forlife.ru
Включение в программу Форума специализированной секции «Биобанки» обусловлено возрастающей ролью, которую играет Биобанкирование в развитии персонализированной медицины и снижении смертности в РФ в контексте Указов Президента Российской Федерации.
Скриншоты и расписание онлайн Секции «Биобанки» 22 сентября 2022 г. 9:30-17:00 (мск.)
ЦКП Морской биобанк» ННЦМБ ДВО РАН, который является членом Национальной ассоциации биобанков и специалистов по биобанкированию (НАСБио) в лице руководителя ЦКП Орловой Т.Ю. представил доклад на тему «5 лет Морскому биобанку ННЦМБ ДВО РАН: первые итоги, уроки и перспективы». Доклад был сделан онлайн и вызвал большой интерес у участников секции, в которой участвовало более 450 слушателей.
В целом, в работе Форума приняли участие 7304 участников из 20 стран (2155 очно и 5149 онлайн) , среди них самые видные деятели российской онкологии и иностранные спикеры, были освещены важнейшие вопросы профилактики, диагностики, лечения и реабилитации онкологических пациентов. В рамках Форума состоялись: круглый стол Ассоциации онкологов России, вручение премии им. Академика А. И. Савицкого, заседания множества конгрессов и секций. Мероприятие было организовано Министерством Здравоохранения Российской Федерации, Ассоциацией онкологов России, ФГБУ «НМИЦ радиологии» Минздрава России, Российской Ассоциацией терапевтических радиационных онкологов, Ассоциацией организаторов здравоохранения в онкологии. Возглавлял организационный комитет Каприн Андрей Дмитриевич – президент Ассоциации онкологов России, главный внештатный специалист-онколог Минздрава России, генеральный директор ФГБУ «НМИЦ радиологии» Минздрава России, Академик РАН, д.м.н., профессор.
В адрес Форума были присланы приветствия от Президента России Владимира Путина, Председателя Правительства Михаила Мишустина, Председателя Совета Федерации Валентины Матвиенко. Владимир Путин в своем приветственном адресе подчеркнул, что «форум можно считать состоявшимся. Он доказал свою эффективность в борьбе за здоровье нашего населения и всего мира». Прозвучало много приветствий и от руководителей НМИЦ и ведущих ВУЗов, представителей профессиональных сообществ и членов РАН.
https://nmicr.ru/news/tsentra/chetvertyy-den-foruma-radi-zhizni-for-life-den-za-dnem/
01.11.2022
Сотрудники ЦКП Морской биобанк приняли участие в работе Первой Всероссийской научно-практической конференции с международным участием "Россия в Десятилетии ООН наук об океане", которая проходила в г. Москве с 24 по 28 октября 2022 г. при поддержке Минобрнауки России, Межведомственной национальной океанографической комиссии (МНОК) и Морской коллегии при Правительстве Российской Федерации Laravel (ocean-and-we.ru). Конференция проводилась Национальным комитетом по Десятилетию ООН наук об океане и была призвана осветить проводимую в России работу по достижению семи ожидаемых результатов Десятилетия, а также по решению ключевых сквозных вопросов, включая управление данными и знаниями, развитие потенциала.
В рамках секции «БЕЗОПАСНЫЙ ОКЕАН» в среду 26 октября с 15:40 по 18:00 мск прошло заседание круглого стола "Мониторинг и изучение вредоносного цветения воды в российских водах Мирового океана" https://ocean-and-we.ru/ru/application/26/10 . В работе круглого стола приняли участие сотрудникиННЦМБ ДВО РАН, Института проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова РАН, Тихоокеанского океанологического института им. В.И. Ильичева ДВО РАН, ФИЦ ИнБЮМ им. А. О. Ковалевского РАН, Камчатского филиала ТИГ ДВО РАН, ИАПУ ДВО РАН, НИИ "АЭРОКОСМОС", Морского геофизического института РАН, Атлантического Отделения ИО РАН, Модератор - Винников К.А., директор ИМО ДВФУ. Вопросы для обсуждения включали:
- Причины и частота возникновения масштабных явлений вредоносного цветения воды (ВЦВ)
- Устойчивость морских прибрежных экосистем при возникновении масштабных ВЦВ
- Влияние ВЦВ на здоровье человека и морских млекопитающих
- Методы спутникового зондирования ВЦВ
Руководитель ЦКП "Морской биобанк" Татьяна Орлова участвовала в работе удаленно и выступила с докладом «ВЦВ в российском секторе Тихого океана и Арктики, как возрастающая угроза здоровью человека и прибрежным экосистемам», который вызвал большой интерес у участников совещания.
Программа Круглого стола:
- Винников Кирилл Андреевич, Ph.D., директор Института Мирового океана Дальневосточного федерального университета (ИМО ДВФУ), вступительное слово, «Масштабный красный прилив на Камчатке осенью 2020 года и его последствия»
- Орлова Татьяна Юрьевна, к.б.н., с.н.с., ведущий научный сотрудник Национального научного центра морской биологии им. А.В. Жирмунского ДВО РАН (ННЦМБ ДВО РАН), «ВЦВ в российском секторе Тихого океана и Арктики, как возрастающая угроза здоровью человека и прибрежным экосистемам»
- Коростелев Сергей Георгиевич, д.б.н., директор Камчатского филиала ФГБНУ Тихоокеанский институт географии ДВО РАН, «Результаты изучения восстановительного потенциала прибрежных экосистем юго-восточной Камчатки после ВЦВ осенью 2020 г.»
- Рожнов Вячеслав Владимирович, академик РАН, д.б.н., главный научный сотрудник Института проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова РАН (ИПЭЭ РАН), «Морские млекопитающие в водах Камчатки и феномен ВЦВ»
- Лобанов Вячеслав Борисович, к.г.н., заведующий отделом Тихоокеанского океанологического института им. В.И. Ильичева ДВО РАН (ТОИ ДВО РАН), «Возможные абиотические факторы экологической катастрофы в Авачинском заливе Камчатки в 2020 году»
- Алексанин Анатолий Иванович, д.т.н., руководитель Спутникового центра Института автоматики и процессов управления ДВО РАН (ИАПУ ДВО РАН), «Возможности и проблемы распознавания вредоносной микроводоросли и стадии ее цветения по данным спутникового дистанционного зондирования океана»
- Суслин Вячеслав Владимирович, к.ф.-м.н., в.н.с., заведующий отделом динамики океанических процессов Морского геофизического института РАН, «Трехканальный региональный спутниковый алгоритм оценки концентрации хлорофилла а: инструмент для диагностирования «цветения» воды»
- Замшин Виктор Викторович, с.н.с., заведующий отделом НИИ «АЭРОКОСМОС», «Исследование спутниковыми методами естественных и антропогенных воздействий на прибрежные акватории Камчатки»
- Ежова Елена Евгеньевна, к.б.н., в.н.с., заведующая Лабораторией морской экологии АО ИО РАН, «Цианобактериальные цветения и цианотоксины в Южной Балтике и ее прибрежных лагунах»
- Ланге Евгения Кирилловна, н.с., Лаборатория морской экологии АО ИО РАН, «Потенциально-токсичные цианобактерии Финского залива»
- Дмитриева Ольга Александровна, к.б.н., н.с., Лаборатория морской экологии АО ИО РАН, «Мониторинг цианобактериальных цветений в мелководных заливах Южной Балтики»
22.09.2022 г.
Сотрудники ЦКП "Морской биобанк" приняли участие в работе Второй школы молодых ученых по марикультуре «Современная марикультура. Биологические, биохимические и молекулярно-генетические подходы», которая проходила на МБС «Восток» с 8 по 11 сентября 2022 г. В рамках школы были рассмотрены современные проблемы культивирования морских беспозвоночных, а также новые подходы и методы исследований биологических объектов для создания научного базиса марикультуры и совершенствования технологий выращивания животных.
https://mp.weixin.qq.com/s/zOM6UlsOx-3hqwVIcmz2cg
Результаты работы Морского биобанка были представлены в докладе Орловой Т.Ю. "Морской биобанк" был создан в 2017 году на базе существующих уникальных биологических коллекций, находящихся в ННЦМБ ДВО РАН. Морской биобанк предназначен для сбора, хранения, изучения, обмена и внедрения результатов по широкому спектру морских биологических образцов в соответствии с передовыми технологиями и сочетает в себе возможности роботизированного криохранилища морского биоматериала (LiCONiC STC Compact ULT -80°C; THE BIOSAFE-420), передовых технологий обработки (TECAN Freedom EVO 150/8, TECAN Spark®) и средств контроля и доступа («BIOSAFE ®-Control ß», образцы FreezerPro и C+CRYO System). На сегодняшний в Морском биобанке представлен широкий спектр биологических проб, а также проб морских отложений, в том числе глубоководных, собранных в экспедициях Центра с помощью телеуправляемого аппарата Comanche 18. Коллекция биобанка включает отечественные клоны и штаммы морских микроводорослей и цианобактерий, в том числе, вызывающих вредоносное цветение воды и продуцирующих фикотоксины; коллекция генетических ресурсов представлена биоматериалами морских млекопитающих из Приморского океанариума. В докладе были показаны сложности, связанные с работой Морского биобанка, в том числе проблемы, которые могут стать препятствием для межведомственного и трансграничного сотрудничества, ограничивающим доступ к образцам и данным. В докладе были озвучены перспективы развития Морского биобанка ННЦМБ ДВО РАН.
По просьбе слушателей, Орлова Т. Ю. сделала внеплановый доклад «Камчатский «медвежий» прилив, которого никто не ждал», в котором представила информацию об организмах, вызвавших вредоносное цветение водорослей (ВЦВ) у берегов Камчатки осенью 2020 года, сопровождавшееся массовой гибелью животных в Авачинском заливе и представлявшего угрозу здоровью людей, контактировавших с водой в районе Халактырского пляжа. Обсуждались возможные причины, приведшие к беспрецедентному для морских вод РФ масштабному и продолжительному явлению ВЦВ.
Фотографии предоставлены Никитой Волченко.