В том случае, если в отобранной пробе фитопланктона количество колоний нужного вида незначительно (1 колония на 7–10 полей зрения), прибегают к получению смешанной накопительной культуры микроводорослей. Для этого в 100 мл питательной среды f добавляют 20–30 мл из отобранной пробы фитопланктона, предварительно тщательно перемешав ее, разливают полученную суспензию в 3–4 чашки Петри диаметром 110 мм и экспонируют их на свету при температуре 20ºС в течение 2–3 сут. Затем все чашки просматривают. В случае обнаружения необходимого количества колоний нужного вида (1–2 в поле зрения) приступают к процедуре его выделения в чистую культуру.
Порядок и последовательность действий описаны в разделе "Получение альгологически чистой культуры". После получения альгологически чистой культуры водоросли переносят из чашек Петри в колбы Эрленмейера для получения накопительной монокультуры.